Sekelompok petani di dusun terpencil berhadapan dengan perubahan musim yang sangat aneh dan mendadak. Mereka kemudian mencari penjelasan secara mistis guna menelusuri penyebabnya, padahal fenomenal yang mereka alami sebetulnya adalah contoh kecil dampak global warming.
Negeri di Bawah Kabut mengobservasi keseharian sepasang keluarga petani di Desa Genikan, lereng Gunung Merbabu. Ketidaktahuan terhadap kondisi pemanasan global bersumber dari rendahnya tingkat pendidikan, yang pada akhirnya bermuara pada kabut tak berujung bernama kemiskinan.